新食品安全法对保健食品涉及颇多，注册、备案的双轨制，强调量效关系等法规的变化对我国保健食品产业发展有着深刻的影响。一个产业的健康和可持续的发展是多种因素共同作用的结果，中国社科院食品药品产业发展与监管研究中心主任张永建表示，从监管端来说，要在转变经济发展方式、促进产业结构调整、保障产品安全的新形式下，不断探索建立与之相适应的、科学高效的监管方式。例如，通过对原料和原料目录的管理，通过对功能、功能声称和标识的管理，促进保健食品产业和企业的创新。转变保健食品监管方式是改革、是创新、是发展，完成这个转变不仅需要勇气更需要智慧。官、产、学要加强交流沟通，不同理念观点的碰撞，会使决策更民主、更科学，使未来行动的基础更扎实。张永建提出，要多管齐下，全方位入手，全面促进保健食品产业的健康发展，他从科学、标准、市场等方面提出11条建议。
提高科技支撑 促进自主创新
    要提高科技支撑能力，促进自主创新。在结构调整中，应坚持科学技术的引领，推进科技创新和技术进步，增强自主创新、集成创新和引进消化吸收再创新的能力。通过积极采用高新技术和先进适用技术提升产业发展的质量，促进加快科技成果推广应用和产业化步伐，促进新功能的研发，提高产品的科技含量。完善综合监管的科技体系，提升综合监管的科技支撑能力。
健全标准体系 保障产品安全有效
    建立健全保健食品的功能声称、功能评价、安全评价、检测方法等方面的标准体系，加强产品功效成分的检测和评价技术的研究，统一、规范产品认证认可体系，完善产品安全检测和监测系统体系。加强对保健食品的严格管理，进一步确立“预防为主”和“全过程管理”的指导思想，健立和完善生产的准入和淘汰机制，落实相关法律法规和技术标准，健全完善安全风险管理体系，强化企业是产品安全第一责任人的理念，推动企业按照GMP要求进行改造，保障产品的安全性和有效性。
注重营养和功能因子的结构 发展天然健康产品
    遵循以营养和医学科学为指导，注重保存产品原料固有的营养成分，优化产品的营养和功能因子结构，提高加工产品的营养质量，重视和加强对标签和功能声称的指导和统一管理。顺应“绿色”、“天然”的消费理念，发挥我国独特的资源优势，积极研发天然健康产品。
坚持市场导向 维护公平竞争
    坚持市场经济的发展方向，充分发挥市场对资源配置的决定性作用，用法律、政策和多种措施支持体系维护公平竞争的市场环境，特别要加强企业守法合规经营的管理，坚决打击假冒伪劣产品，重典治乱，减少“劣币驱逐良币”，维护和保证投资者、生产经营者和知识产权拥有者的合法权益，促进支撑产业的发展。
突出多种优势 促进集聚发展
    遵循经济规律，充分发挥不同区域的比较优势，加快资本、技术、人才等要素向优势产区和优势行业流动，促进产业延伸，培育产业集群，形成各具特色的健康产品和服务的加工产业带（区）。突出传统文化优势，促进以我国传统养生文化为基础的健康产品在不同特色地区和不同产品系列的集聚与发展。
提高核心竞争力 培育、保护知名品牌
    通过加快产品结构调整，加强新产品开发力度，提高产业集中度，维护竞争秩序，运用有效的产业政策和科学的管理等多种方式，提高我国健康产业的竞争力。努力培育和打造知名品牌，通过市场竞争，扩大提高知名品牌产品的市场影响和市场份额。做好商标宣传，提高产品竞争力。进一步扩大开放，鼓励和支持中国企业参与国际竞争，开拓国际市场，争创国际知名品牌。
坚持绿色发展 提高资源利用效率
    坚持可持续发展，全面树立保护环境前提下发展的理念。注重发展的可持续性，节约资源，降低资源消耗。综合利用，提高资源综合利用水平和产品出品率，确保资源的合理利用和可持续利用。通过转变发展方式，调整产业结构，努力发展资源深度加工，有效延长产业链，促进农产品及其他初级原料的转化增值，通过技术进步，进一步拓宽保健食品产业发展的空间。
优化产业组织结构 增强产业竞争力
    进一步优化产业组织结构，发展混合经济。通过跨国、跨区域、跨行业、跨所有制的资源整合，通过联合、兼并、收购等资本运作方式，实现“强强联合”、“强弱联合”，通过市场、科技、资本、政策等多种手段，适度提高研发—生产—销售的关联和集中程度，发挥市场对资源配置的决定性作用，通过充分竞争，产生出一批资本结构多元化、产品科技含量高、市场竞争力较强的大企业、大集团和龙头企业，提高产业的竞争力。
加强科学监管 构建长效运行机制
    科学、严密、完整的监管是保健食品产业“发展中规范”向“规范中发展”转变最重要的外部约束和最重要的推动。要按照党的“十八大”及三中、四中全会的精神，在简政放权的总体要求下，进一步深化监管改革，完善顶层设计，积极探索更加有效的监管方式，构建长效运行机制，既保证安全又兼顾发展，既体现公平又兼顾效率。通过科学监管，促进产业发展方式的转变和结构调整，促进产业竞争力的提升和又好又快地健康发展，从根本上保障健康产品的安全有效。
发挥行业组织作用 推动完善行业自律
    完善行业协会和其他中介组织的服务职能，充分发挥其在信息统计、行业规划、行业自律、技术咨询、贸易仲裁、反倾销与应诉、法律规范与标准制定、人才培训、技术交流和社会化服务等方面的作用，推动行业自律，支持行业协会等中介组织积极开展民间交流，建立与各国同行间的合作伙伴关系。
加强公众健康意识
注重健康知识的教育培训
    科学良性的消费会促进市场和产业的良性发展。针对我国公众健康素养普遍较低的突出问题，应进一步加大对公众健康意识和健康知识教育培训的财政投入，支持不同主体开展对公众的健康意识和健康知识教育培训，充分利用电视、网络、报纸、广播、微信等多种平台和传播渠道宣传健康意识和健康知识。